换乘停车场的票价结构是对换乘系统的补充。按照经济效益、社会效益、差别费率和累积费率的原则，制定停车收费办法，促进换乘停车场经营的产业化。在具体实施过程中可采用市场调节价、政府指导价和政府定价三种机制，并实行“统一政策、分级管理”的收费管理办法。
在P&R换乘设施投入使用初期，为了吸引出行者使用P&R，可以通过降低或减免停车费用等优惠政策减少人们对小汽车的依赖。待时机成熟可考虑依据相关政策适当收取停车费用以收回建设成本。换乘停车场成本是指换乘停车场建设、经营中发生的各种消耗的货币表现。它主要包括：
1）土地使用费、各种设施的建造及维护费、购置的设备及其运行和维修费、工资、水电费、各种保险和税金、公共费（治安费）和勤杂费（工本费）等。
2）由于停车时发生的交通拥堵也消耗了资源，我们把它称为社会成本。
换乘停车场可以采取多种收费方式、收费标准。参照国际经验，可以采取以下形式收费：
1）P&R停车费相对于其他形式的停车设施收费便宜，吸引出行者换乘公共交通；
2）实行按月、按季度收取P&R停车费，相对于按次收费有较大幅度的优惠；
3）与公交卡实现无缝衔接，采用公交卡支付停车费后，可以在当日对公交乘坐费用实现优惠。
4）相关折扣：采用公交卡支付停车费的当日，换乘公交的费用5折优惠；
由于北京P&R刚刚起步，因此，低廉的收费政策需要有完善的管理体系做保障，否则容易形成收费漏洞，停车设施被一些非P&R停车目的的车辆使用，从而失去了P&R的建设初衷。因此，建议建立相应收费管理保障体系，比如与公共交通联合收费的形式，从而保障P&R设施仅提供给换乘车辆的停车需求。
