由于公交企业必须注重社会效益，不可能完全按照市场原则运转，因此造成经营上的困难。再加上私人小汽车所支付的费用并未达到真实而完全的社会和外部成本。所以使公共交通在与私人交通的竞争中处于劣势，以至广大居民无法享受到高品质的“行”的权力。那么，从社会发展和进步的角度来看，对能够满足大众需要，有利于改善城市环境、提高生活质量的公交企业，由政府给予一定补贴显然是合情合理、无可厚非的。
2、补贴的程度和范围
基于以上的理由，可以将补贴的对象和补贴的程度划定一个范围。补贴对象以“有存在必要”和“有改善希望”的公交企业为主。补贴程度以“恰好能够抵偿运营成本”或“企业内部管理刚刚可能得以改善”为恰当。因为补贴只能是辅助性的工具，仅能提供维持运营的基本条件，真正的改善和发展还要靠企业自身的努力。补贴过度过滥会造成社会资源的浪费，必须以制定合理的条件限制加以避免。
3、补贴方式的合理架构
大多数学者基本同意补贴方式可分为“非金钱的补贴方式”与“金钱补贴”两部分，本文根据这个思路对补贴方式进行大的架构分类，并分别进行说明。
A、非金钱补贴。 非金钱补贴指政府不需要直接支付金钱给企业，而是从政策、规划等方面予以支持。通过非金钱补贴方式改善公交企业的经营环境，增强公交企业在市场上的竞争力，鼓励公交企业通过本身改善经营提高服务质量的努力。许多学者认为非金钱补贴的方式在实际中切实可行，效果显著，在一些场合往往能够起到金钱无法起到的作用。
首先，公交运营面临着私人小汽车的严重竞争，使公共交通大容量、高效率的优越性难以发挥出来。小汽车大量占用和消耗社会资源如道路、停车场、燃料等，但不能提供高效率的运力，还产生许多外部成本和社会成本，如噪声、污染和道路拥堵，却在税费上没有真实的反映出来。政府部门采取增加小汽车牌照税及燃料税、增加小汽车高速公路通行费、提高停车场费率和在相应路段限制通行等措施，这样可以使小汽车的使用和总量增长受到抑制，从而使公交企业的运行条件得到改善。
第二，政府部门可以采用行政手段给予公交企业营造有利的经营环境，这可以从两方面着手：一是制定或修改法令法规，使之有利于公交企业的运转与发展；二是制定有预见性的、全面的城市公共线网场站建设规划。这是十分重要，可能是非金钱补贴措施中比较重要的一条。完整的规划不但可以提高公共交通的运行效率和经营效果、改善交通状况，也可以吸引更多出行居民转向公共交通。
B、金钱补贴。 金钱补贴可以再细分为“资本补贴”和“运营补贴”。资本补贴是对公交企业大的资产成本（如车辆、场地及新技术设备投入等）给予直接的资金援助。由于这些大的投入一般情况下公交企业本身无力负担，政府可以采用低利贷款或编列预算的方式给予适当的补贴。资本补贴一般用在以下三个方面：
1、车辆更新补贴；
2、租赁购置停车场地；
3、新技术推广应用。
运营补贴是指考核公交企业的经营情况，根据实际需要予以适当、合理的经济援助。运营补贴也分为绩效补贴与亏损补贴两项。考核的主要内容是公交企业的投入产出比，主要是对由于公交服务的社会效益造成过高成本，超过合理收入部分给予的补贴，也就是所谓的“亏损补贴”。另一方面，奖励的方式主要考核公交企业的服务质量和管理水平，也就是以工作绩效当作补贴的依据，也就是所谓的“绩效补贴”。公交企业的管理者一般比较重视亏损补贴，而很多学者认为绩效补贴才有激励作用。事实上，这二者可以并行不悖而同时分别进行。如果说亏损补贴是给予公交企业“量的满足”，则绩效补贴就是要求公交企业“质的提升”。二者配合发挥各自长处，可以对公交企业的全面进步产生巨大的推动。 4、考核制度
建立和完善考核制度。主要目的是确保各项补贴能切实有效地发挥作用。非金钱补贴部分要建立一套完善的考核制度是十分困难的，因为这种补贴方式多为无形效益，或需要经过时间来
