北京市发改委曾经预计，随着两三年时间内一卡通系统的逐步普及，IC卡发行量将超过200万张。然而，从该系统试运行两年来所暴露出的种种问题来看，拥有1600万人口的北京市，一卡通的发行量还不到20万张。要想让它真正为企业认可、百姓满意，达到提高整个城市科技水平、提高效率的目的，相关部门还有许多工作需要完善。
出错·局限
李琳，每天都要乘坐801公共汽车上下班，一提到一卡通的使用，他就满肚子的苦水。每月至少有一次刷卡金额错误的问题，每次金额出错，司乘人员总是搪塞说系统出了故障，让他无可奈何。还有，大部分司机上车刷卡后不按进站键，每次下车前都要提醒司机，否则无法实现下车刷卡。
李琳告诉记者：“一次乘车卡机出错导致多刷金额，在向乘务员说明时，竟然被他们轰下了车。”
目前，使用IC卡最方便的只有轨道交通，可当前范围有限，只有北京城铁13号线可以。地铁1、2号线因其设计年代较早，空间有限，改造难度大，目前均不能实现，按照规划，2007年年底才能完成刷卡设备的安装。
记录·拆帐
乘客遇到问题，会登录北京市政交通一卡通的网站查询，但网站只能提供近期20次的刷卡记录，而且内容“缺斤短两”。据北京市政交通一卡通有限公司的工作人员介绍，目前，公司只能提供3 个月内20次的消费记录，如果需要详细查询并出具书面证明，需要到一卡通公司缴费查询。
这位工作人员向记者解释，目前，乘坐公交车的消费记录来源于公交公司，每次收车时，公交员工通过采集卡采集当天的刷卡记录，再通过网络将刷卡记录上传到一卡通公司，这一时间最长为一周。
