2007年10月，中共十七大报告明确指出，要加大机构整合力度，探索实行职能有机统一的大部门体制。随后有报道称，交通、铁道、民航可能会进入第一批实行“大部制”的名单，并入“大运输部”。
刘志军在2008年1月11日的全国铁路工作会议上明确表示，到目前为止，他没有得到相关指示。
在刘志军看来，实行“大部制”有利于提高管理效率，统筹协调行业发展中出现的问题。这也是国外公共行政管理的成功经验。但是，中国铁路当前面临的最重要问题是路网不足，运力资源短缺、滞后，“当前，铁路部门一定要把主要精力放到搞建设上来。”刘志军说。
他表示，铁路改革应坚持“有利于保持路网完整性、有利于运输组织集中指挥、有利于提高运输效率”的方向和原则。
一直以来，铁道部实行政企合一的管理体制。2002年，铁道部原部长傅志寰大力推动“网运分离”改革，其后试点遭遇种种困难而被迫暂停，中国铁路管理体制改革由此陷入迷局。
2003年，刘志军接任铁道部部长之后，将工作重点转向铁路发展与建设。刘志军指出，到2010年，全国铁路营业里程将达到9万公里以上，为实现这一目标，今后三年将有1.5万公里铁路新线建成投入运营。
在本次铁路工作会议上，刘志军还表示，2008年铁道部将对运输主业实行减员增效，引导精简人员向铁道部下属的多元经营企业流动。他指出，铁路运输业人员过剩，随着装备改善，人员配备应有所减少。
“京沪高速铁路股份有限公司将定员50人，京津城际铁路有限责任公司定员20人。”刘志军在会上说。
铁道部多元经营企业主要依托铁路运输业发展第三产业，包括仓储、商饮、旅游服务、房地产、居民服务行业等。据悉，2007年，全路多元经营资产总额为892亿元，营业收入1300亿元，实现利润30亿元。
